Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SirpaP97797 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SirpaP97797 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SirpaP97797 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SirpaP97797 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SirpaP97797 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SirpaP97797 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SirpaP97797 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SirpaP97797 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms