Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cry1P97784 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms