Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc1P97496 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc1P97496 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc1P97496 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms