Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp1P97309 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms