Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h3bP84228 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms