Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms