Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NyxP83503 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NyxP83503 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NyxP83503 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NyxP83503 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NyxP83503 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NyxP83503 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NyxP83503 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NyxP83503 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NyxP83503 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NyxP83503 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NyxP83503 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NyxP83503 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms