Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms