Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad50P70388 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad50P70388 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms