Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncoa1P70365 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncoa1P70365 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms