Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp4P70343 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp4P70343 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms