Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbx6P70327 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbx6P70327 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms