Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux2P70298 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux2P70298 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux2P70298 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux2P70298 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux2P70298 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cux2P70298 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms