Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgif1P70284 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgif1P70284 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms