Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp3P70281 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms