Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf6P70279 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf6P70279 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf6P70279 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms