Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrx1P63013 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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