Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab3cP62823 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Rab3cP62823 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rab3cP62823 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rab3cP62823 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rab3cP62823 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3cP62823 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3cP62823 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Rab3cP62823 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rab3cP62823 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab3cP62823 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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