Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsnl1P62761 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vsnl1P62761 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms