Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms