Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms