Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps11P62281 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps11P62281 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms