Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rps29P62274 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms