Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms