Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms