Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rin3P59729 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rin3P59729 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms