Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b6P59708 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms