Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp1P59054 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp1P59054 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csrnp1P59054 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms