Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd4P58467 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Setd4P58467 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms