Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dpf3P58269 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms