Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpdl3bP58242 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpdl3bP58242 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms