Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpa1P57784 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpa1P57784 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms