Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms