Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1P56716 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1P56716 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms