Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc4rP56450 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms