Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1bbP56400 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms