Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdaP56389 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdaP56389 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdaP56389 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CdaP56389 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CdaP56389 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms