Protein–RNA interactions for Protein: P55937

Golga3, Golgin subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Golga3P55937 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Golga3P55937 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Golga3P55937 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Golga3P55937 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Golga3P55937 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Golga3P55937 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Golga3P55937 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Golga3P55937 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms