Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd3P55096 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms