Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacnb3P54285 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacnb3P54285 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms