Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PitpnbP53811 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PitpnbP53811 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms