Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PctpP53808 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PctpP53808 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PctpP53808 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PctpP53808 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PctpP53808 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PctpP53808 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PctpP53808 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PctpP53808 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PctpP53808 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms