Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp1P52624 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp1P52624 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms