Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ApodP51910 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ApodP51910 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ApodP51910 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApodP51910 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApodP51910 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApodP51910 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms