Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec1P51908 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms