Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LumP51885 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LumP51885 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LumP51885 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LumP51885 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LumP51885 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LumP51885 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LumP51885 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LumP51885 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LumP51885 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms