Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr4P51680 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms