Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CastP51125 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CastP51125 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CastP51125 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CastP51125 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CastP51125 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CastP51125 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CastP51125 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CastP51125 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CastP51125 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CastP51125 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CastP51125 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CastP51125 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CastP51125 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CastP51125 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms