Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TspoP50637 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TspoP50637 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TspoP50637 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TspoP50637 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TspoP50637 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms