Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SftpdP50404 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SftpdP50404 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms